论文笔记整理：杨帆，浙江大学计算机学院。

动机

现有的用于图结构的预训练方法要么只关注node-level，导致在图表示空间没有区分度，要么只关注graph-level，导致在节点表示空间没有区分度。一种优质的节点表示应该保证不仅在节点层面有良好的区分度，而且由这些节点表示生成的图的表示在全图层面也有良好的区分度，所以预训练过程应同时考虑到node-level和graph-level。

模型

本文提出的模型主要包括node-level预训练和graph-level预训练两部分，其中node-level预训练包括context prediction和attribute masking两种实现方法。

1. Node-level pre-training

2. 1. Context prediction

该方法定义了Neighborhood和Context graph两个概念，利用两个GNN分别对每个节点的Neighborhood和Context graph进行编码，然后通过负采样技术，训练一个二分类器判断一个Neighborhood表示和一个Context graph表示是否对应相同的节点，以此聚合周围节点的属性信息和邻近的图结构信息。

1. 1. Attribute masking

该方法首先随机选取某些节点的属性将其MASK（把原始属性用特殊的标识符替换掉），然后使用GNN对节点编码生成节点表示，最后通过线性模型预测被MASK的属性值。

    2. Graph-level pre-training

首先将节点的表示聚合起来得到图的表示，然后在图上进行多个二分类任务的联合训练。

实验

1. 数据集

数据集包括生物和化学两个领域，生物领域的任务是蛋白质功能预测，化学领域的任务是分子属性预测。

1. 实验结果

2. 1. ROC-AUC performance

1. 1. Negative transfer

加入graph-level预训练后，可以很好地防止Negative transfer（使用预训练效果反而差于不使用预训练的效果）的出现。

1.      c. 收敛性

采用本文中的预训练策略能够有效加快收敛速度。

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